蛋白质相互作用工作站(Octet RED 96)
简介：
蛋白质相互作用工作站(〇ctet RED 96)是一种利用BLI技术实时分析的非标记检测仪，能跟踪检测溶液中分子与生物传感器之间的结合、解离整个过程的变化，包括蛋白质-蛋白质，蛋白质-小分子。
技术优势：
①具有快速数据采集能力和极高的灵敏度；
②分析与确认靶标可与逆向筛选靶标同时进行；
③可直接检测混合物(如血清、细胞裂解液，组织匀浆等)。
应用场景：
① 药物研发：药物筛选、药物设计等；
② 生物研究：病原体与宿主细胞的相互作用、蛋白质结构与功能研究等；
③ 工业生产：用于制药、食品、化工等行业的质量控制、原材料筛选等。
应用意义：
①可以通过分析不同突变体与特定配体的亲和力，筛选具有**亲和性的候选物；
②可以通过分析蛋白质、抗体、病毒等生物分子之间的相互作用，开展细胞生物学、免疫学、微生物学等领域的研究。
相关发表文献 Relevant Published Literatures
[1] The molecular mechanism of cytoadherence to placental or tumor cells through VAR2CSA from Plasmodiumfalciparum(PMID:34663782)
(一区IF:33.5)
通讯：王岚峰，中国科学院上海巴斯德研究所微生物、发育与健康中心，中国科学院分子病毒学与免疫学重点实验室，中国科学院大学生命科学学院。
科学问题:
妊娠相关疟疾(PAM)威胁着流行地区的妇女及婴儿。VAR2CSA由恶性疟原虫的var基因亚家族编码，在感染红细胞与胎盘的细胞粘附中具有重要作用，其特异性配体是硫酸软骨素A(CSA)。但目前VAR2CSA影响胎盘或肿瘤细胞的细胞粘附的分子机制仍不清楚。
实验方法：
使用凝胶过滤色谱法分析有无CSA的VAR2CSA-50-962和VAR2CSA-50-962-9位点突变。OctetRED96用于测试VAR2CSA外部区域VAR2CSA-50-962和VAR2CSA-50-962-9位点突变的CSA结合亲和力。使用共聚焦荧光显微镜进一步验证了9位点突变可以消除VAR2CSA与胎盘细胞或肿瘤细胞的结合活性。
结果及结论：
研究阐明了VAR2CSA介导的细胞粘附在胎盘或肿瘤细胞上的详细分子机制，研究结果可能有助于PAM疫苗研发的抗原设计，并改善靶向胎盘和肿瘤细胞的药物递送系统。
[2] Structural insights for neutralization of Omicron variants BA.1, BA.2, BA.4, and BA.5 by a broadly neutralizing SARS-CoV-2(PMID:36197988)
(一区IF:13.6)
通讯：Anmol Chandele，印度新德里国际遗传工程和生物技术中心，埃默里疫苗中心
科学问题：
单克隆抗体(mAb)疗法虽然已经在冠状病毒病中初现成效，但病毒的传播和突变会导致变异株的出现，进而逃避治疗性抗体以及天然疫苗获得性免疫的中和。目前大多数mAb对奥密克戎(B.1.529.7)变异株及其亚谱系的中和活性降低，这表明了对识别新兴变异株有效mAb的持续需求。
实验方法：
本研究对印度新冠病毒康复者的单个B细胞中分离的多种人源单克降抗体(mAbs)进行鉴定，发现了一种具有受体结构域(RBD)的特异性单克隆抗体002-S21F2，该抗体具有罕见的基因用途，并强烈地中和了SARS-CoV-2变异株病毒。
结果及结论：
对002-S21F2与Omicron和WA.1的三聚体复合物的结构研究表明，002-S21F2向ACE2结合基席之外的RBD外表面的一个构想保守表位，从而为其广泛的中和活性提供了机制见解。002-S21F2及其靶向广谐中和表位的发现对开发SARS-CoV-2变异株的治疗和疫苗干预具有及时意义。
[3] Molecular determinants and mechanism for antibody cocktail preventing SARS-CoV-2(PMID: 33473140)
(一区IF:16.6)
通讯：安志强，美国德克萨斯治疗研究所，布朗基金会分子医学研究所，德克萨斯大学休斯顿健康科学中心
科学问题：
抗体混合物是防止SARS-CoV-2逃逸的潜在方法。选择抗体组合的决定因素以及抗体混合物阻止病毒逃逸的机制尚不清楚。
实验方法：
我们比较了多种中和抗体和混合物使用的受体结合域(RBD)中的关键残基，确定了两种抗体CoV2-06和CoV2-14的组合能够防止病毒逃逸。
结果及结论：
两种抗体同时与非重叠表位和独立竞争受体结合。SARS-CoV-2 可通过在体外产生抗性突变逃脱单一抗体，但由于对RBD-ACE2 相互作用和RBD蛋白折叠要求的限制，不会从混合物中逸出。此外研究还发现了SARS-CoV-2和SARS-CoV共有针对CoV2-12抗体的保守中和表位，CoV2-06和CoV2-14单独或联合治疗对小鼠有保护作用。这些发现可为抗体混合物治疗COVID-19提供新见解。