生物大分子检测(OlAxcel Advanced)

2024-04-19

生物大分子检测.jpg

仪器:生物大分子分析仪(QIAxcel Advanced)


简介:

生物大分子分析仪(QIAxcel Advanced)是一款高分辨率毛细管电泳仪,用于分析DNA、RNA、蛋白质等生物大分子。



技术优势:

①便利:快速分析多达96个样本,无需人工介入,采用安全、操作简单的即用型预制胶;

②高速:QIAxcel Advanced电泳速度比传统琼脂糖凝胶电泳快15倍以上,可以在几分钟内分析出样品;

③高分辨率:其微细毛细管和高灵敏的激光检测,使得分析结果具有极高的分辨率和准确性,可检测到浓度低至0.1ng/uL的核酸,分辨率可达3-5 bp;

④智能化:自动识别和定量样品,智能化分析数据和快速生成结果报告,界面友好。



应用场景:

基因测序前的质量控制,如PCR扩增等;生物样品分析,如血液、组织等;蛋白质分析,如酶活性分析等;疾病诊断,如检测病原体、遗传性疾病等。还可以用于生产领域,在制定新药或疫苗时,也可以使用该仪器对生产的产物进行快速识别和分析。



应用意义:

快速分析DNA、RNA、蛋白质分子的大小、纯度、浓度和检测等重要参数,为后续的实验研究提供了准确可靠的数据支持,同时提高了实验效率,有助于高通量分析与药物筛选分析。


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[1] MLVA subtyping of listeria monocytogenes isolates from meat products and meat processing plant(PMiD: 29579922)

(一区IF:8.1)

通讯:Teresa Aymerich,IRTA,食品安全计划


科学问题:

李斯特菌(Listeria monocytogenes)是一种广泛分布于肉制品和肉类加工业的食源性致病菌,针对鉴定其污染和传播途径的分子分型技术仍存在局限性。

实验方法:
将包括对照株以及来自肉制品和肉类加工厂的113个分离菌株,使用QlAxcel Advanced系统(Qiagen)进行多位点串联重复序列(MLVA)分析,ABI3730xI DNA分析仪(Life Technologies)作为参考方法。

结果及结论:
首先所有分离菌株(N=113)共获得了27个不同的MLVA谱型,其中24个对应于肉类工业分离物(N=106)。并比较了MLVA和多位点序列分型(MLST)结果。结果表明使用MLVA作为主要方法可以高精度地预测序列类型。因此,MLVA可以作为现有亚型鉴定方法的一种快速、可靠和高通量替代品,用于李斯特菌在肉类加工业的监测和控制。


[2] intermittent BRAF inhibition in advanced BRAF mutated melanoma results of a phase ll randomized trial(PMID:34853302)

(一区IF:16.6)

通讯:Alfonso Berrocal,西班牙瓦伦西亚瓦伦西亚总医院


科学问题:

BRAF(BRAFi)加MEK抑制剂(MEKi)的联合治疗可以提高携带活性BRAF突变的晚期黑色素瘤患者生存率,但易出现肿瘤复发。研究表明间歇用药可延缓药物耐药性的出现,在后续随机开放性临床试验中发现BRAFi和MEKi间歇用药效果不佳,该作用机制尚未阐明。

实验方法:
本研究将70名患者随机分为连续用药组和间歇用药组,利用QIAxcel Advanced DNA分析仪对患者血液中纯化的cfDNA进行BRAFV600突变和定量分析以及NGS测序,分析间歇用药治疗效果不佳的作用机制。

结果及结论:

结果发现,BRAFi和MEKi联合治疗BRAF突变阳性的晚期黑色素瘤的效果并没有优于标准的连续用药方案。肿瘤DNA中BRAF突变的检测对生存率有预后价值,其动态与临床反应具有良好的相关性,但没有改善患者生存周期。此外,8例放射学进展病例的靶向NGS分析显示有耐药基因的突变。综上所述,确定进展期血浆样品中不同的耐药机制,有助于指导针对每一病例的新型靶向药物研究。


[3] HPV73 in cervical cancer and distribution of HPV73 variants in cervical dysplasia(PMID: 33837548)

(一区IF:6.4)

通讯:Ola Forslund,瑞典隆德大学临床科学系外科,斯科讷大学医院


科学问题:

除高危HPV类型外,HPV73可能具有致癌性,但在大多数商业原发性HPV筛查平台没有建立HPV73突变筛查。
实验方法:
本研究将对69例子宫颈癌FFPE样本、206例宫颈癌液体细胞学样本和5807例Aptima HPV阴性癌和严重发育不良的液体细胞学样本分别提取DNA后利用QIAxcel Advanced 系统进行多重MGP-PCR、PCR扩增产物测序以及Luminex检测。
结果及结论:
结果发现,HPV73在FFPE宫颈病标本中的检测率远低于Aptima HPV阴性的LBC样本,其检测率分别为2.9%和55.5%,且HPV73在不同级别的宫颈癌诊断中检测率为29.3%。此外,HPV73中A2变异体出现率最高为82.7%。综上所述,以上数据为HPV73检测纳入未来的原发性宫颈病筛查提供可靠的理论依据。

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